Tujuan PS Doktor Biologi FMIPA UNS adalah menyelenggarakan program pendidikan S-3 melalui serangkaian proses pembelajaran sehingga menghasilkan lulusan dengan kompetensi yang mengacu pada  Peraturan Presiden Nomor 8 Tahun 2012 tentang Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI) yang antara lain:

  1. Menghasilkan doktor yang memiliki penguasaan filosofi keilmuwan biologi berintegritas tinggi, profesional, kreatif, dan inovatif di bidang bioproduk.
  2. Menghasilkan karya-karya inovatif dan berkualitas yang mendukung perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi di bidang Bioproduk.
  3. Mewujudkan lembaga pendidikan dan penelitian yang berperan sebagai pusat  rujukan ilmu dan teknologi di bidang Bioproduk.
  4. Mendiseminasikan hasil pendidikan dan pengajaran, serta penelitian di bidang Bioproduk kepada masyarakat, sehingga terjadi transformasi terus menerus untuk mewujudkan kehidupan yang lebih baik.

Strategi pencapaian VMTS :

  1. Peningkatan kualitas pendidikan, penelitian, dan P2M dosen agar dapat menyelenggarakan proses belajar mengajar (PBM) dengan baik.
  2. Peningkatan pelaksanaan PBM yang berkualitas dan efisien serta pemanfaatan sumber daya yang ada di PS secara hemat dan bertanggungjawab.
  3. Peningkatan kerjasama strategis dengan institusi lain untuk peningkatan kualitas penelitian dan kegiatan pengabdian kepada masyarakat.
  4. Peningkatan kerja sama pendidikan, penelitianm dan P2M dengan instansi pemerintah dan swasta, baik dalam dan luar negeri.

Mengikutsertakan staf dosen dalam pelatihan penulisan artikel ilmiah untuk meningkatkan kemampuan penulisan dan publikasi ilmiah terutama yang siap dipublikasikan pada jurnal terakreditasi nasional maupun terindeks internasional.